No existen datos concretos de la fundación de Almogía, pero sí se puede afirmar, gracias a los restos encontrados de una calzada, que en la época romana ya fue un lugar importante de paso y comercio. Sin embargo su configuración como núcleo de población tiene lugar con la dominación árabe. Los musulmanes otorgaron a la localidad su nombre actual que significa `La Hermosa`. De esta época se conservan los restos de una fortaleza que fue destruida por el ejército de los Reyes Católicos en 1487. Después de la fallida rebelión morisca de 1570, las tierras de Almogía fueron ocupadas por cristianos viejos procedentes de Antequera y Teba. De esta época tienen fama las aguas medicinales del Sultán. El manantial se conserva en la actualidad pero sus instalaciones se encuentran en estado ruinoso.