La diversidad de climas y de medios existentes en la comunidad tienen como consecuencia un gran número de especies animales y vegetales adaptadas a ellos. En los Pirineos, junto a los ríos crecen alisos, sauces y hayedos, servales, fresnos, arces, avellanos, boj... A mayor altura crecen lo pinos y, a cotas superiores, las praderas que dan lugar a suelos cubiertos de líquenes, musgos y algunos endemismos y plantas curiosas como el edelweis..
Este es el hogar de animales como las truchas, los tritones, las culebras y víboras, los quebrantahuesos, las águilas reales, la perdiz nival, el pito negro y el dorsiblanco, el sarrio, el jabalí, el gato montés, el tejón, la graduña, la gineta, la marta, el zorro, etc. y algunos osos pardos (que van de un lado a otro de la frontera con Francia).
El bucardo, la cabra pirenaica no ha podido ser conservada pese al plan especial de protección.
En zonas como Los Monegros, amplias llanuras deforestadas y cubiertas por matorrales, se encuentran habitadas por especies esteparias como la ortega, el alcaraván y la avutarda.
Además de los ibones pirenaicos (lagos de origen glaciar) existen importantes lagos y lagunas en zonas interiores: la laguna de Sariñena, la de Gallocanta... y "galachos" o meandros abandonados del Ebro. La vegetación en estos medios acuáticos consiste en carrizales, praderas de juncos, tarayales, bosques de ribera, gramíneas, etc.
Los animales que viven en este lugar son los peces (barbos y bogas son los más importantes), varias especies de anfibios y de reptiles (galápagos y culebras de agua) y mamíferos entre los que cabe señalar la nutria.
Las aves más destacables son el avetoro, el avetorillo, el martinete, la garceta común y otras como la cerceta común, el ánade rea, el sibón, el pato colorado, el porrón común, la cigüeñela, la pagaza piconegra, el fumarel cariblanco, las fochas, zampullines... Los galachos y las lagunas poseen gran importancia para las aves migratorias como las grullas, etc.