Debido a la variedad climática se aprecian distintos tipos de flora. En el norte, la estepa predomina en el Sahel, así como los parajes desérticos y en el sur la sabana arbórea y los arbustos. En algunos lugares, principalmente al borde de los ríos, la vegetación es tan alta que impide ver las aldeas, sobre todo después de las lluvias. Antes de la sequía crece deprisa el sorgo, el mijo, las chufas o los cacahuetes.
En el Parque Nacional de Baule se pueden ver distintas especies de antílopes, búfalos, jirafas, leones y panteras. Hay además otras reservas naturales como Badinko y Kongossombugu. En la zona de Bamako, que corresponde a la sabana, se puede encontrar la típica fauna de este medio tal como elefantes, leones, leopardos, guepardos, hienas, y serpientes de gran tamaño. En los desiertos abundan, como es natural, los dromedarios.