Gracias a la diversidad geográfica de Marruecos, se puede encontrar una extensa variedad de especies animales y vegetales distribuidos entre las dunas de sus desiertos, las áridas estepas y las refrescantes sombras de sus oasis, las marismas de sus costas y las elevadas cumbres..
el desierto y la estepa aunque igualmente áridos, contienen especies distintas y variadas. La estepa contiene la artemisa blanca, el azufaifo espinoso con sus frutas rojas, la tawarza, el arbusto de latex que prevalece en los cauces de los río.
La fauna cuenta con animales adaptados a su hábitat como el chacal dorado, el dromedario que se cubre con un pelo más largo en el invierno , la perdiz moruna, aves como las gangas, las ortegas, los camachuelos, los corredores, las collalbas y los gorriones, el lagarto como el de cola espinosa o el de Bribrón y serpientes como la Psammophis Shokari y la salamanquesa, así como roedores, meriones, jerbos o gerbillos. Existen además otras muchas especies entre las que destacan fenecs ,armadillos, liebres y hienas..
En el desierto, se pueden encontrar euforbos del Rey Juba, auzones, plantas fredolias varanos del desierto, escincos conocidos como peces del desierto, moscaretas de cabeza gris, zorros del Sáhara, escarabajos, ardillas de Berbería, escorpiones negros, hienas rayadas, liebres del Cabo, gacelas Dorcas, jerbos, meriones de Libia, gerbillos y un buen número de aves como buitres negros , collalbas de cabeza blanca o cabeza rubia, terreras saharianas, alondras del desierto, corredoras, gangas coronadas, camachuelos trompeteros, collalbas del desierto, alondras cornudas, chorlitos del desierto, halcones borní, búhos ascalafos y gorriones blancos entre otras tantas.
En los márgenes del río Massa, se pueden contemplar porrones, alondras, mirlos, jabalíes, meloncillos, quebrantahuesos, garzas reales y gacelas, águilas, mumones, ibis y tórtolas.
La zona del Lago de Merdja Zerga esta caracterizada por su abundancia de aves. Alli se pueden encontrar distintas especies de aves, especialmente en los meses de invierno, como garcillas bueyeras, ánades reales, gallinetas, andarríos bastardos, agujas colinegra, espátulas, golondrinas de mar , cigueñelas, tarroblancos, gaviotas barbudas y flamencos, entre otras distintas especies.
La fauna marina marroquí comprende más de 240 especies: gambas, pulpos, lubinas, langostas, caballas, calamares, salmonetes, doradas, anchoas y atunes rojos. Destacan otros peces como pargos, lenguados, salmonetes de roca, rascacios rojos, róbalos, mújoles y jureles. El litoral marroquí cuenta con una gran variedad de aves como vuelvepiedras, chorlitejos grandes, gaviotas canas o charranes patinegros, entre otras muchas.
En las cumbres del Atlas vuelan los quebrantahuesos, las águilas calzadas y reales, las alondras cornudas y las chovas piquirrojas.
En los bosques de cedros destacan las peonías, los algarrobos, el enebro rojo, el pistachero del Atlas y como fauna, las ardillas de Berbería, el azor oscuro, los macacos de Berbería , el colirrojo de Musier, el águila culebrera, el autillo, las jinetas y el leopardo. El bosque de Mamora destaca por sus eucaliptos, pinos, acacias y alcornoques y por sus camaleones africanos, cigüeñas blancas, papamoscas grises, carracas y tórtolas.
En los oasis y palmerales se pueden contemplar especies como el doum, la pequeña de Canarias, la palmera enana y la hermosa Sabal palmetto, entre más de 25 especies. En cuanto a la fauna, los oasis son el hábitat de ruiseñores de los jardines o de los sapos de Mauritania, entre otras especies.
Parques Nacionales y Reservas:
Entre los Parques Nacionales hay que destacar el Parque nacional de Talassemtane de Xauén, el Parque Nacional Toubkal de Marrakech, el Lago de Sidi Bourhaba de Mehdiya, Santuario Natural de Bouarfa de Bouarfa, el Parque Nacional del Souss-Massa de Agadir y el Parque Nacional Merdja Zerga de Mulay Bousselham