La mezquita de Bebek es un ejemplo del primer período nacionalista en la arquitectura turca. Este estilo arquitectónico fue formulado por los primeros graduados de Turquía en la Escuela de Bellas Artes en Estambul en el siglo 20 e hizo uso de los elementos formales y decorativos de las primeras obras del otomano en Bursa. La mezquita está construida de piedra cortada. Se compone de una sala de oración con cúpula y un pórtico de tres bahías hacia el noroeste, a la entrada de las cuales hay una placa con letras de oro inscritas en él. Tramos laterales del pórtico han planteado plantas que se describen con balaustradas de mármol. En el lado izquierdo del pórtico, hay unas escaleras que conducen a un balcón de madera que se utiliza sólo por mujeres.
La sala de oración tiene una planta cuadrada que está cubierta solo una gran cúpula circular de tambor. Ocho arcos, se unieron para formar un cinturón de planta octogonal, que soportan la cúpula y son apoyados por ocho pilares octogonales. En las cuatro esquinas de la plaza, hay exedras semi-cubiertas de cúpulas. El mihrab tiene un nicho de estalactita encerrado en un marco tallado. La estructura de madera (mimbar) está a la derecha del mihrab. Las ventanas del triforio y la cúpula permiten que suficiente luz suficiente entre y pueda encender el interior de la mezquita que está pintado con escenas de mosaico tradicional en tonos claros de rojo y azul.
En el exterior de la mezquita, mini torres aparecen alrededor del tambor circular, que en realidad son extensiones del interior de ocho pilares de apoyo de la cúpula. Estas mini-torres tienen una línea de cornisa escalonada en su base. Las ventanas en el tambor están separadas por pilastras que tienen más bien un estilo neo-clásico. Hay semi-cúpulas por encima de las exedras en las cuatro esquinas del techo de la plaza. En la esquina occidental de la mezquita se levanta un minarete único sobre una base cuadrada alta y tiene un eje de múltiples facetas.