Durante la dominación romana de la zona Pécs fue la capital de la provincia de Pannonia. La ciudad tomó el nombre de Quinque Ecclsiae la Ciudad de las Cinco Iglesias cuando estuvo bajo la administración del arzobispo de Salzburgo. En el siglo XI el rey Esteban construye en la ciudad la primera catedral de Europa y en 1367 se funda la primera Universidad de Hungría. Los turcos también dominaron la ciudad durante un siglo y medio, una invasión que llevó a la ciudad a convertirse en un rico centro comercial. En la actualidad Pécs es un importante centro universitario conocido por el champaña Pannonia y la porcelana Zsolnay.