La ciudad se funda en el año 1525 bajo la supervisión del conquistador español Gonzalo Alvarado, quien recibió órdenes de su hermano Pedro de fundar la villa de San Salvador.
Cuenta en su "currículum" con haber sido la primera ciudad americana en tener una imprenta, en el año 1641, cuyo primer ejemplar fue el libro titulado "El Puntero Apuntado con Apuntes Breves".
La ciudad ha sufrido a lo largo de su historia varios ataques corsarios, terremotos, huracanes devastadores, inundaciones, etc. Hoy es una ciudad cosmopolita donde se mezcla la tradición de la cultura maya con el modernismo de las grandes urbes.