Uruguay posee una fauna y flora muy especial, gracias a que se encuentra en el punto justo donde se diferencias las zonas tropicales y templadas, por lo que pueden verse especies de ambos ecosistemas.
A pesar de que la geografía dominante son las praderas que ocupan cerca del 80 del territorio nacional, el paisaje del país es muy diverso. Se contabilizan cerca de 2.500 especies de plantas y unas 224 de árboles y arbustos, más de 100 mamíferos, 400 aves, 60 reptiles y unas 400 especies de peces.
En las praderas prevalecen las gramíneas, numerosas aves y el ñandú, mientras que en las llamadas praderas arboladas, puede verse el ave nacional: el hornero. Por otro lado, los humedales, que ocupan grandes extensiones de tierra especialmente en los departamentos de Treinta y Tres y Rocha, acogen una importante fauna, entre mamíferos, aves y anfibios. Los Bañados del Este han sido declarados Reserva de la Biosfera. Los bosques ocupan un 3,5 de la superficie total, siendo el hábitat de numerosas especies de animales como la pava de monte ave selvática, trepador grande, boyero pico de hueso o carpintero de los cardones.