El Museo de Arqueología Subacuática de Bodrum se estableció en el Castillo de Bodrum en 1964. Inicialmente, la prioridad era la restauración del castillo; posteriormente, se crearon salas de exposiciones en el espacio disponible. Hoy en día, hay 14 salas de exposiciones en el Museo de Bodrum.

El Salón del Vidrio fue inaugurado en 1986, con la asistencia de la Fábrica de Vidrio y Botellas Pasabahçe. Aquí se proporciona información general sobre la colección de vidrio del museo. Los especímenes se exhiben en la oscuridad, con iluminación desde abajo. Este método de exhibición permite una mejor visualización de todas las diversas marcas y colores del vidrio. Se exhiben especímenes que datan del siglo XIV a. C. al siglo XI d. C. La sala también contiene un acuario, que se ha colocado en una hendidura en la pared
La excavación e investigación del naufragio más antiguo del mundo que data del siglo XIV a. bajo la dirección del Prof. Dr. George Bass, y luego bajo la dirección del Dr. Cemal Pulak, bajo los auspicios de la Universidad de Texas A.M. y el Instituto de Arqueología Subacuática. La carga del barco consistía principalmente en lingotes de cobre. También hay más de 150 lingotes de vidrio redondos, planos, de resina, de color azul cobalto, turquesa y lavanda. Estos lingotes constituyen los artefactos de vidrio más antiguos del Museo de Arqueología Subacuática de Bodrum.

. El acuario tiene un modelo pequeño pero detallado, que ilustra una excavación submarina.

Todos los especímenes encontrados en las excavaciones de Uluburun entre 1984 y 1995 se exhibirán en Uluburun Shipwreck Hall, cuya inauguración está programada para 1999
El barco romano oriental, que data del siglo VII d. C., fue excavado entre 1961 y 1964 por un equipo bajo la dirección del Prof. Dr. George F. Bass. Fue reconstruido a tamaño real en una antigua capilla que se utilizó como sala de exposiciones antes de 1997. En el barco reconstruido se exhiben modelos y especímenes reales. Se cree que el barco se hundió después de encallar en un banco de arena cerca de Yassıada.
Los cristales rotos y los lingotes de cristal que estaban guardados en sacos y cestas en la bodega del barco revelan que se trata de un barco comercial. En las ánforas se transportaban zumaque y pasas, junto con fragmentos de vidrios rotos. El barco se fechó examinando monedas de cobre, monedas fatimíes de oro y pesas de vidrio en las que estaba impreso el nombre del califa fatimí.

La sala mencionada anteriormente fue construida por el Ministerio de Cultura especialmente para la exhibición de los restos de madera del naufragio Serçe Limanı, su vidrio y otros artefactos.