Fundado en los primeros años del reinado de Bayezid II, el Cuerpo del Palacio de Gálata era una institución educativa donde los estudiantes de Enderun, la institución palaciega, recibían su educación primaria y secundaria. Como es bien sabido, los estudiantes de Enderun eran elegidos entre los estudiantes devshirme que asistían a la Escuela del Palacio de Edirne, al Cuerpo de İbrahim Paşa, a los palacios de İskender Çelebi o al Cuerpo del Palacio de Gálata. A estos alumnos se les denominaba "acemioğlanlar" (novatos o cadetes).

Para que pudieran adaptarse al Imperio Otomano en todos los ámbitos, estos muchachos recibían enseñanza de idiomas, principalmente turco, árabe y persa. En las escuelas mencionadas recibían formación según sus talentos en música, caligrafía y equitación, así como en deportes tradicionales como lanzamiento de jabalina y tiro con arco. Entre los que completaban con éxito su educación, algunos eran seleccionados para asistir a Enderun mientras que otros eran asignados como kapıkulu ("sirvientes de la Puerta"). En este sentido, el Cuerpo del Palacio de Gálata había sido la fuente más importante del Imperio Otomano durante mucho tiempo, y debía su éxito a la disciplina alcanzada en su organización interna. El cuerpo contaba con tres barracones de 200 personas cada uno y una mezquita, un baño turco y una clínica. Estaba dirigido por 22 "Agha" (jefes y comandantes), uno de los cuales era el comandante en jefe (Bashagha).

También había un cirujano, un médico, un farmacéutico, un oficinista, un panadero, un bañista, un lavandero y un imán. El personal docente de la escuela estaba compuesto por maestros cuyos salarios eran pagados por el palacio; se proporcionaban siete monedas de plata (akche) al día. Además de las competiciones y actividades deportivas que se celebraban regularmente todas las tardes, los días más animados eran las reuniones de alumnos y padres que se celebraban todos los martes.
El cuerpo se reabrió durante el reinado de Ahmed III (1703-1730) en 1715 y quedó subordinado a Silahtar Agha. El cuerpo se dividía en tres clases: subalterno, medio y superior. Cuando la escuela empezó a recuperar su importancia anterior, los sultanes empezaron a premiar al cuerpo. En consecuencia, se formó una rica biblioteca, con cientos de libros que fueron enviados desde palacio durante el reinado de Mahmud I (1730-1754). Sin embargo, la educación sufrió una breve interrupción, que había continuado sin problemas hasta entonces, debido al incendio de Tophane en 1820.

La escuela se reconstruyó en piedra durante el reinado de Mahmud II (1808-1839), aunque se disolvió en 1834, cuando se abolió Enderun. Algunos edificios se destinaron a la Escuela Imperial de Medicina (Mekteb-i Tıbbıye), y el resto se utilizó como cuartel. En 1865, las clases preparatorias de todas las escuelas militares (marina, academia militar, escuela de medicina y escuela de ingeniería) de Estambul se reunieron bajo el mismo techo.

A pesar de que algunos alumnos del Mektebi Sultani (Instituto Imperial de Galatasaray) que se alistaron voluntarios para participar en la Guerra de Independencia turca no regresaron del frente, la victoria nacional fue recibida con gran alegría en el instituto como en todas partes. A partir de ese momento, la escuela tomó su lugar como una de las instituciones educativas modernas de la joven república, con el nombre de la escuela secundariade Galatasaray. Mientras que las escuelas primarias que impartían educación religiosa, como las madrasas y las escuelas de minorías religiosas, se cerraron de acuerdo con la Ley de Unificación de la Educación, el Instituto Galatasaray permaneció abierto debido a su carácter laico que se había mantenido desde 1868. Los cursos culturales empezaron a impartirse en turco. Atatürk, que concedía gran importancia a la educación, visitó la escuela en tres ocasiones, lo que demuestra el aprecio que sentía por la institución; es más, la mayoría de los parlamentarios de su entorno eran graduados del Instituto Galatasaray.

Además, al convertirse en mixto, tal y como prescribe la educación moderna, Galatasaray abrió el camino a otras escuelas bien establecidas que habían mantenido sus actitudes conservadoras al respecto hasta un pasado reciente. En 1968, el Presidente de Francia, Charles de Gaulle, visitó la escuela con motivo del centenario de Mektebi Sultani. En 1975, la escuela adquirió el estatus de Instituto de Enseñanza Secundaria de Anatolia, y el periodo de estudios se redujo a ocho años en función de las implementaciones llevadas a cabo por el Ministerio de Educación. Finalmente, de acuerdo con un protocolo firmado por el Presidente de Francia, François Mitterrand, y el 8º Presidente turco, Turgut Özal, el 14 de abril de 1992, la Institución Educativa Integrada de Galatasaray (Galatasaray Eğitim Öğretim Kurumu) comenzó a impartir educación, con la inclusión de la escuela primaria, que había estado cerrada desde 1969, y una unidad universitaria.

La Institución Educativa Integrada de Galatasaray se transformó en la Universidad de Galatasaray en virtud de la Ley nº 3993, que entró en vigor tras su publicación en el Boletín Oficial nº 21952 el 6 de junio de 1994. Aunque la institución adquirió el estatus de universidad, mantuvo su condición de institución educativa integrada; así, el Instituto Galatasaray, así como la escuela primaria dependiente del mismo, se definieron como unidades educativas regidas por la Oficina del Presidente (K.m.1).